深大城际先开段机场东站-黄麻布站区间左线长4661.275m，右线长4700.967m。区间共设置10处联络通道，区间于黄麻布站前设置明挖段（兼做盾构始发井）。

机场东站～黄麻布站区间自黄麻布区间明挖段出发后，依次下穿勒杜鹃公园，凤凰山脉，京港澳高速，在建 12 号线机场东车辆段，12 号线黄田站附属及钟屋～黄田站区间，地铁 1 号线后瑞～机场东高架区间，后接入机场东站。区间为双洞单线隧道。

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